Factor de Rho,

Un? factor es una proteína procariota implicado en la terminación de la transcripción. Factor de Rho se une al sitio de pausa terminador de la transcripción, una región expuesta de ARN monocatenario después de que el marco de lectura abierto en secuencias ricas en GC que carecen de estructura secundaria evidente.

Rho factor de transcripción es una proteína esencial en procariotas. En Escherichia coli, que es un ~ 275 kD hexámero de subunidades idénticas. Cada subunidad tiene un dominio de unión a ARN y un dominio de hidrólisis de ATP. Rho es un miembro de la familia de helicasas hexameric dependientes de ATP que la función de los ácidos nucleicos, envolviendo alrededor de una sola hendidura que se extiende alrededor de todo el hexámero. Rho funciona como un factor auxiliar para la ARN polimerasa.

Hay dos tipos de terminación de la transcripción en procariotas, terminación dependiente del factor intrínseco y terminación. Terminadores Rho dependiente representan aproximadamente la mitad de la E. coli terminadores dependiente del factor. Otros factores de terminación descubiertos en E. coli incluyen Tau y Nusa. Terminadores Rho-dependientes fueron descubiertos por primera vez en los genomas de bacteriófagos.

Un factor Rho actúa sobre un sustrato de ARN. Función de la tecla de Rho es su actividad helicasa, para el cual la energía es proporcionada por una hidrólisis de ATP dependiente de ARN. El sitio de unión inicial para la Rho es una región extendida de cadena sencilla, rica en citosina y pobres en guanina, llamado el lugar de utilización rho o rutina, en los ARN que se está sintetizando, aguas arriba de la secuencia real terminador. Varias secuencias de unión rho se han descubierto. No hay consenso se encuentra entre éstos, pero las diferentes secuencias de cada uno parece ser específico, como pequeñas mutaciones en la secuencia interrumpe su función. Rho se une al ARN y luego utiliza su actividad ATPasa para proporcionar la energía para trasladar a lo largo de los ARN hasta que llega a la región de ARN-ADN helicoidal, donde se desenrolla la estructura dúplex híbrido. ARN polimerasa se detiene en la secuencia de terminación, que se debe a que hay un sitio específico en torno 100NT lejos del sitio de unión Rho llamado el sitio de pausa de Rho-sensible. Así, a pesar de que la ARN polimerasa se trata de 40nt por segundo más rápido que Rho, no plantea un problema para el mecanismo de terminación Rho como la ARN polimerasa permite factor de Rho para ponerse al día.

En resumen, el factor de Rho actúa como una enzima desenrollado dependiente de ATP, moviéndose a lo largo de la molécula de ARN de nueva formación hacia su extremo 3 'y desenrollado desde el molde de ADN a medida que avanza.

Una mutación sin sentido en un gen de un operón que impide la traducción de los genes posteriores en la unidad. Este efecto se denomina polaridad mutacional. Una causa común es la ausencia del ARNm correspondientes a las partes posteriores de la unidad. Supongamos que hay terminadores Rho-dependiente dentro de la unidad de transcripción, es decir, antes de que el terminador de que por lo general se utiliza. Normalmente no se usan estos terminadores anterior, debido a que el ribosoma impide Rho de llegar a la ARN polimerasa. Sin embargo, una mutación sin sentido libera del ribosoma, de manera que Rho es libre para unirse a y/o mover a lo largo del ARN, lo que le permite actuar sobre la ARN polimerasa en el terminador. Como resultado, la enzima se libera, y las regiones distales de la unidad de transcripción nunca se transcriben.